生物肥含有多種功能性微生物他們進入土壤后，在生長繁殖過程中會產生大量的次生代謝產物，這些產物能夠促進土壤團粒結構的形成。

團粒結構的形成能使土壤變得疏松、綿軟，保水保肥性能增強，水、氣、熱更加協調，減少土壤板結，有利于保水、保肥、通氣和促進根系發展，為農作物提供舒適的生長環境。

此外，土壤微生物還有固氮作用

在植物根系周圍生活的土壤微生物還可以調節植物生長，植物共生的微生物如根瘤菌、菌根和真菌等能為植物直接提供氮素、磷素和其他礦質元素的營養以及有機酸、氨基酸、維生素、生長素等各種有機營養，促進植物的生長

在菌肥生產中載體很重要，關乎菌的活性能力。

而土壤中有足夠的有機物或腐殖質時微生物才能更好的生存繁殖起作用，激活其他營養元素。

微生物菌在土壤中作用主要是產生各種酶，分解各種養分，產生各種酸和二氧化碳，給作物提供更多養分。而微生物菌要成活和繁殖，土壤中要有足夠的有機質才行。

土壤有機質含量足，土壤理化性狀就好，加強了土壤有益微生物的活動，從而*大限度促使有機物分解轉化，產生多種營養物質和刺激性物質，反過來又刺激微生物的生長發育，促進作物生長，*終達到增產增收的目的。這也是我們提倡有機肥搭配菌肥一起使用的一個重要因素！所以要想土壤健康作物高產，不能光施用化肥，微生物和有機質！缺一不可！